Nonostante normalmente venga venduta come tale, non è una specie adatta ai comuni acquari di comunità, in quanto richiede acqua pulitissima e non è un forte competitore alimentare, anche se ciò non vuol dire che vada allevata completamente da sola. Sono particolarmente indicati come compagni di vasca gruppi di piccoli e pacifici caracidi che abitino il livello medio-superiore della vasca o simili, in quanto la presenza di piccoli banchi di pesci sembra essere usato come un indicatore del fatto che non vi è alcuna minaccia immediata nelle vicinanze, e quindi può contribuire a ridurre la loro naturale timidezza agendo da pesci rassicuranti.

Possono essere inseriti anche pacifici abitanti del fondo, come Corydoras spp. e molti tra i loricaridi più piccoli. Assicuratevi di fare ricerche in modo molto approfondito sugli eventuali compagni di vasca, ed evitate pesci territoriali e/o aggressivi, tra cui la maggior parte degli altri ciclidi, e quelli che richiedono acqua più dura.

Mikrogeophagus altispinosus è un ciclide relativamente gregario e dovrebbe idealmente essere allevato in un gruppo di sessi misti di 6-8 esemplari o più.

La cosa essenziale è fornire un substrato di sabbia fine, che i pesci possano esplorare con la bocca come fanno in natura. Usare ghiaino o ciottoli può inibirne l'alimentazione, danneggiarne le branchie e danneggiarne e/o bloccarne l'apparato digestivo.

Non amano una forte corrente nell'acqua, per cui bisogna dirigere opportunamente l'uscita del filtro, che non deve generare troppa corrente. Sono intolleranti all'accumulo di inquinanti, e per non farli ammalare bisogna fare regolari cambi d'acqua non troppo massicci, sono consigliati cambi settimanali del 10-15% max del volume della vasca.

Non andrebbero mai inseriti in acquari non ben maturi.

In acquario dovrebbe essere offerta loro una dieta varia di cibo vivo e congelato come chironomus, artemia, daphnia, integrati da mangime secco affondante di buona qualità, di dimensioni adeguatamente ridotte.