E' meglio allevarli da soli o, se proprio si vuole allevarli con altre specie, possono essere tenuti in un acquario misto di comunità contenente altre piccole specie autoctone come Pseudomugil gertrudae; se la geografia non è un problema, con Microdevario, Danionella, Eirmotus, Trigonostigma, Corydoras pygmaeus, piccoli loricaridi come Otocinclus e gamberetti d'acqua dolce dei generi Caridina e Neocaridina.

E' una specie che in natura vive in banchi, e dovrebbe essere allevata in un gruppo di almeno 6 esemplari, l'ideale è di 10 o più.

 La filtrazione non deve essere particolarmente forte in quanto provengono principalmente da acque pigre e non apprezzano affatto la corrente veloce. Non inserite questi pesci in un acquario biologicamente immaturo in quanto possono reagire negativamente alle oscillazioni nella chimica dell'acqua.

Iriatherina werneri si nutre di fitoplancton galleggiante o sospeso, diatomee, e altro zooplancton, e in acquario devono essere offerti alimenti di dimensioni adeguate alla sua piccola bocca. Idealmente una gran parte della dieta dovrebbe comprendere alimenti vivi come Daphnia, Moina, naupli di Artemia, microworm, copepodi, etc, anche se sono accettati anche mangimi secchi galleggianti tritati/di piccole dimensioni.